Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC97Q96F63 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC97Q96F63 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms