Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYFIP2Q96F07 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms