Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX21Q969T3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX21Q969T3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms