Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM63Q969Q1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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TRIM63Q969Q1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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TRIM63Q969Q1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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TRIM63Q969Q1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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TRIM63Q969Q1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM63Q969Q1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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