Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGP1Q92546 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms