Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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