Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBLCP1Q8WVY7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBLCP1Q8WVY7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms