Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
TRIM41Q8WV44 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
TRIM41Q8WV44 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRIM41Q8WV44 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms