Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX29Q8TEQ0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX29Q8TEQ0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms