Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM71BQ8TC56 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms