Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSNK2A3Q8NEV1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms