Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBR7Q8N806 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBR7Q8N806 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms