Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRC43Q8N309 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.6 ms