Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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LINC00528Q8N1L1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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LINC00528Q8N1L1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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LINC00528Q8N1L1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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LINC00528Q8N1L1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00528Q8N1L1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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LINC00528Q8N1L1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00528Q8N1L1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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LINC00528Q8N1L1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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LINC00528Q8N1L1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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LINC00528Q8N1L1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00528Q8N1L1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00528Q8N1L1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00528Q8N1L1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00528Q8N1L1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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LINC00528Q8N1L1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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LINC00528Q8N1L1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00528Q8N1L1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00528Q8N1L1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00528Q8N1L1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00528Q8N1L1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00528Q8N1L1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00528Q8N1L1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00528Q8N1L1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00528Q8N1L1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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