Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PASD1Q8IV76 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PASD1Q8IV76 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms