Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRX1Q86UT6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLRX1Q86UT6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms