Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE3BQ7Z3V4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE3BQ7Z3V4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms