Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP0

NIPA1, Magnesium transporter NIPA1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA1Q7RTP0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPA1Q7RTP0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPA1Q7RTP0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPA1Q7RTP0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPA1Q7RTP0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPA1Q7RTP0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPA1Q7RTP0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPA1Q7RTP0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPA1Q7RTP0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPA1Q7RTP0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPA1Q7RTP0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPA1Q7RTP0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPA1Q7RTP0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NIPA1Q7RTP0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NIPA1Q7RTP0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NIPA1Q7RTP0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPA1Q7RTP0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms