Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HS2ST1Q7LGA3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS2ST1Q7LGA3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms