Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q7L0L9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q7L0L9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q7L0L9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q7L0L9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q7L0L9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q7L0L9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q7L0L9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q7L0L9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q7L0L9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q7L0L9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q7L0L9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q7L0L9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q7L0L9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q7L0L9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q7L0L9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q7L0L9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q7L0L9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q7L0L9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q7L0L9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q7L0L9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q7L0L9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q7L0L9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q7L0L9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q7L0L9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q7L0L9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q7L0L9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q7L0L9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q7L0L9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q7L0L9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q7L0L9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q7L0L9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q7L0L9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q7L0L9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q7L0L9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q7L0L9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q7L0L9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q7L0L9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q7L0L9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q7L0L9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q7L0L9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q7L0L9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q7L0L9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q7L0L9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q7L0L9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q7L0L9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q7L0L9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Q7L0L9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q7L0L9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q7L0L9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q7L0L9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q7L0L9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q7L0L9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q7L0L9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q7L0L9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q7L0L9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q7L0L9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q7L0L9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q7L0L9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q7L0L9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q7L0L9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q7L0L9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q7L0L9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q7L0L9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q7L0L9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q7L0L9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q7L0L9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q7L0L9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q7L0L9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q7L0L9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q7L0L9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q7L0L9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms