Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00173Q6ZV60 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00173Q6ZV60 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms