Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SRCAPQ6ZRS2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRCAPQ6ZRS2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SRCAPQ6ZRS2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SRCAPQ6ZRS2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SRCAPQ6ZRS2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SRCAPQ6ZRS2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
SRCAPQ6ZRS2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SRCAPQ6ZRS2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRCAPQ6ZRS2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRCAPQ6ZRS2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRCAPQ6ZRS2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRCAPQ6ZRS2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRCAPQ6ZRS2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms