Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CASC2Q6XLA1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms