Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASC1Q6TDU7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CASC1Q6TDU7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms