Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms