Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC174Q6PII3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms