Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFXN4Q6P4A7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFXN4Q6P4A7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms