Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF544Q6NX49 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms