Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF6Q6KF10 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF6Q6KF10 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms