Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3L3Q68CJ9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3L3Q68CJ9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms