Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MYOM3Q5VTT5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MYOM3Q5VTT5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
MYOM3Q5VTT5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
MYOM3Q5VTT5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MYOM3Q5VTT5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms