Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF20Q5VTR2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF20Q5VTR2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms