Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HP1BP3Q5SSJ5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HP1BP3Q5SSJ5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms