Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF628Q5EBL2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF628Q5EBL2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms