Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms