Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALFQ53S48 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALFQ53S48 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms