Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SVEP1Q4LDE5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SVEP1Q4LDE5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms