Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP221Q4G0U5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms