Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SP6Q3SY56 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms