Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP27-1Q3LI81 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms