Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC57Q2TAC2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC57Q2TAC2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC57Q2TAC2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC57Q2TAC2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC57Q2TAC2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC57Q2TAC2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC57Q2TAC2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC57Q2TAC2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC57Q2TAC2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC57Q2TAC2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC57Q2TAC2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC57Q2TAC2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC57Q2TAC2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC57Q2TAC2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC57Q2TAC2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC57Q2TAC2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC57Q2TAC2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC57Q2TAC2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC57Q2TAC2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC57Q2TAC2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms