Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSR1Q2NL82 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms