Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC27Q2M243 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms