Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NREPQ16612 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NREPQ16612 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NREPQ16612 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NREPQ16612 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NREPQ16612 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NREPQ16612 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NREPQ16612 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NREPQ16612 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NREPQ16612 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NREPQ16612 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NREPQ16612 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NREPQ16612 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NREPQ16612 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NREPQ16612 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NREPQ16612 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NREPQ16612 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NREPQ16612 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NREPQ16612 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NREPQ16612 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NREPQ16612 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NREPQ16612 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NREPQ16612 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NREPQ16612 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NREPQ16612 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NREPQ16612 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
NREPQ16612 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NREPQ16612 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
NREPQ16612 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NREPQ16612 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NREPQ16612 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NREPQ16612 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NREPQ16612 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NREPQ16612 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NREPQ16612 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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NREPQ16612 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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NREPQ16612 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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NREPQ16612 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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NREPQ16612 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NREPQ16612 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NREPQ16612 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NREPQ16612 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NREPQ16612 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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NREPQ16612 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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NREPQ16612 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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NREPQ16612 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NREPQ16612 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NREPQ16612 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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NREPQ16612 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NREPQ16612 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NREPQ16612 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NREPQ16612 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NREPQ16612 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NREPQ16612 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NREPQ16612 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NREPQ16612 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NREPQ16612 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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