Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
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DDB1Q16531 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
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DDB1Q16531 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDB1Q16531 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
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DDB1Q16531 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
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DDB1Q16531 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
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DDB1Q16531 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
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DDB1Q16531 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDB1Q16531 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
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