Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX1Q16384 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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