Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALX1Q15699 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALX1Q15699 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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