Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF1Q15637 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF1Q15637 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF1Q15637 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF1Q15637 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF1Q15637 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF1Q15637 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF1Q15637 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF1Q15637 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SF1Q15637 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF1Q15637 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF1Q15637 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF1Q15637 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF1Q15637 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF1Q15637 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF1Q15637 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SF1Q15637 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF1Q15637 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF1Q15637 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF1Q15637 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF1Q15637 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF1Q15637 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF1Q15637 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF1Q15637 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF1Q15637 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF1Q15637 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF1Q15637 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SF1Q15637 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SF1Q15637 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF1Q15637 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF1Q15637 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF1Q15637 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF1Q15637 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF1Q15637 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SF1Q15637 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF1Q15637 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF1Q15637 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF1Q15637 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SF1Q15637 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF1Q15637 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF1Q15637 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF1Q15637 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF1Q15637 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF1Q15637 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SF1Q15637 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF1Q15637 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF1Q15637 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SF1Q15637 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF1Q15637 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SF1Q15637 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF1Q15637 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SF1Q15637 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF1Q15637 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF1Q15637 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF1Q15637 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF1Q15637 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF1Q15637 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF1Q15637 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF1Q15637 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF1Q15637 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF1Q15637 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF1Q15637 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF1Q15637 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF1Q15637 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF1Q15637 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF1Q15637 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF1Q15637 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SF1Q15637 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SF1Q15637 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF1Q15637 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF1Q15637 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF1Q15637 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF1Q15637 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF1Q15637 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF1Q15637 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF1Q15637 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF1Q15637 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF1Q15637 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF1Q15637 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF1Q15637 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF1Q15637 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF1Q15637 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF1Q15637 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF1Q15637 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF1Q15637 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF1Q15637 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SF1Q15637 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SF1Q15637 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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