Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SURF2Q15527 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SURF2Q15527 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms