Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIX1Q15475 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIX1Q15475 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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